1)多彩な蛋白機能解明を目指してのプロテオーム
1　ゲノム科学とプロテオーム解析
菅野純夫

2　プロテオーム解析の原理と応用
大海　忍

3　ミクロの世界の擬態
中村義一

2)プロテオームとドメイン構造（分子間相互作用）
1　癌研究におけるYeast Two-hybridシステムによる相互作用分子の解明
渡邉俊樹

2　プロテインバイオチップの開発とプロテオミクスへの応用
Steffen Nock, Julie Heinrich, Lawrence K. Cohen, Peter Wagner（翻訳：山崎大輔）

3)構造解析による分子間相互作用研究
1　無細胞蛋白質合成系とNMRによる蛋白質基本構造の解析
木川隆則，横山茂之

2　マルチドメイン蛋白質複合体のX線結晶構造解析
箱嶋敏雄

4)プロテオームの応用例
1　プロテオームを利用した癌研究
長野光司

2　病態研究へのプロテオーム応用
大森　彬

3　プロテオームを利用した老化のプロファイリング
戸田年総

1)シグナルネットワークを構築するドメイン構造
1　アダプター，ドッキング蛋白質によるネットワーク
山梨裕司

2　ドメイン構造からみた活性酸素生成のシグナリング
住本英樹，伊藤隆司

3　IRSとシグナリング
小川　渉，春日雅人

4　アダプター・ドッキング蛋白質のノックアウトによる機能解析
堺　隆一

2)リン酸化と脱リン酸化
1　プロテインキナーゼドメインとリン酸化配列
安藤祥司，稲垣昌樹

2　ホスファターゼドメインと標的リン酸化部位−特に基質特異性について
菊池九二三，島　礼

3　チロシンまたはセリン/スレオニンリン酸化部位を認識するドメイン−SH2, PTB, 14-3-3
後藤典子

3)短いペプチドを認識するドメイン
1　分子集積におけるPDZ蛋白質の役割
西村　渉，田中紀章，畑　裕

2　EHドメインを有する蛋白質によるエンドサイトーシスの制御機構
刈屋憲次，菊池　章

4)プロリンに富む配列を認識して結合するドメイン
1　SH3とWWドメインによる認識機序
神田大輔

2　EVH1ドメインによる細胞骨格の制御
加藤真良

5)核内シグナル
1　ヘリックス・ループ・ヘリックス(HLH)蛋白質の構造的基盤
清水敏之，箱嶋敏雄

2　Etsドメインとシグナル伝達
及川恒之

3　RINGフィンガードメインとユビキチンリガーゼ活性
宮内康弘，森實芳仁，本多玲子，安田秀世

4　ウィングドヘリックス/フォークヘッド・ドメインの多様性
西村善文

5　RNA結合蛋白質によるシグナル応答
井上俊介，岡村勝友，塩見春彦

6)その他のドメイン
1　カルシウム結合モチーフとカルモデュリン結合モチーフ
伊倉光彦，Kyoko（京子）L. Yap, Justin Kim, Tao Yuan

2　脂質結合ドメインを介したイノシトールリン脂質の機能発現−PH･ENTHドメイン，FYVEフィンガー
伊藤俊樹

3　アンキリン・ドメインをもつ蛋白と身体の非対称性決定
横山尚彦

4　VPH/WH2ドメインとアクチン重合調節
末次志郎