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実験医学増刊 Vol.26 No.7 2008 |
| 生命研究への応用と開発が進む バイオデータベースとソフトウェア最前線 DNA解析からRNA・タンパク質の機能解明，エピジェネティクス研究，システム生物学と誰もが使う文献検索の新機能 |
◆ 出版社 ◆ 羊土社 〒101−0052 東京都千代田区神田小川町2-5-1 TEL 03-5282-1211 FAX 03-5282-1212 URL https://www.yodosha.co.jp/ |
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序
概論
観測技術の進歩からバイオインフォマティクスの潮流を読む
| ■ 第1章 DNA |
1 ゲノムブラウザー
2 国際HapMapプロジェクト
3 メタゲノムデータベース
4 ゲノム進化のデータベース
5 QTL解析とデータベース
6 ゲノムアセンブラと新型シークエンサーを使用したゲノムシークエンシングの未来
7 超高速シークエンサーの原理と情報処理
8 ゲノム配列のマルチプルアラインメント
9 遺伝子発見
| ■ 第2章 RNA |
1 完全長cDNAデータベース
2 革命的超高速シークエンサーによるSAGE法の進展
3 RNA干渉実験のためのウェブツール
4 機能性RNAデータベース
5 二次構造に基づく機能性RNAの配列解
| ■ 第3章 タンパク質 |
1 タンパク質の機能部位の予測
2 タンパク質とDNAの結合予測
3 アミノ酸配列に基づくタンパク質の細胞内局在予測
| ■ 第4章 エピジェネティクス |
1 DNAメチル化の網羅的解析技術
2 DNAメチル化を中心とした網羅的なエピゲノム解析
3 クロマチン修飾の網羅的解析技術
| ■ 第5章 システム生物学 |
1 パスウェイのモデル化とシミュレーションツール
2 KEGG：生命システム情報統合データベース
3 Wikiによるフラボノイドのデータベース
4 メタボローム解析のための質量分析スペクトル・データベース：MassBank
| ■ 第6章 文献検索とゲノム言語 |
1 医学生物学分野におけるシソーラスとテキストマイニング技術の開発
2 PURE：PubMed文献検索支援システム
3 ゲノムと言語の学際的研究
1 転移因子によるゲノム言語の構築と進化
2 進化計算と遺伝子ネットワーク推定
3 タンパク質糖鎖修飾の新たな意義─細胞内糖タンパク質品質管理機構
4 近縁複数全ゲノム配列比較によるゲノム進化ダイナミクスの解明
5 下水処理プロセスの微生物群集─ゲノム解析で見えるもの見えないもの
| ■ データベース・ソフトウェア INDEX |
| ■ 索引 |
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