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実験医学別冊 ポストゲノム時代の実験講座2
プロテオーム解析法
タンパク質発現・機能解析の
先端技術とゲノム医学・創薬研究
 出版社  羊土社

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礒辺俊明


■ 第1章 総論

1 ゲノムサイエンスの推進とプロテオーム・プロテオミクス研究の役割
安楽泰宏

2 プロテオーム研究の全体像
礒辺俊明 高橋信弘

■ 第2章 タンパク質プロファイリング技術

【プロファイリング技術の現状と展望】
礒辺俊明
 
【二次元電気泳動法によるプロファイリング】
1 プロテオームマップ作成法

田岡万悟 中山 洋

2 プロテオームマップのデータ取り込み/画像解析法1

中村和愛 岡田政喜
3 プロテオームマップのデータ取り込み/画像解析法2
石田友紀
4 特異的検出法を用いたプロファイリング
a) 各種の特異的検出法
真鍋 敬
b) リン酸化タンパク質の検出
柳田光昭 高橋信弘
【多次元クロマトグラフィー法によるプロファイリング】
1 二次元クロマトグラフィー法による
  プロファイリング(マニュアル法)
瀬田和夫 山河芳夫

2 二次元クロマトグラフィー法による
  プロファイリング(自動化法)
礒辺俊明 田岡万悟 高橋信弘
【同位体ラベル法によるプロテオーム変動解析】
小田吉哉
 

■ 第3章 プロテオミクスのためのタンパク質同定法

【タンパク質同定技術の現状と展望】
瀧尾擴士
 
【質量分析による同定法】
1 MS/MSスペクトルに含まれる
  部分配列情報を利用した同定法(質量タグ法)
久保田一石 中村健道

2 de novo sequencingのための解析ソフトウェア
大須賀潤一 里見佳典 高尾敏文
3 翻訳後修飾の同定法
山内英美子 谷口寿章
 
【逐次分解による同定法】
1 エドマン分解法による同定
堂前 直 瀧尾擴士

2 C-末端解析による同定
次田 晧

■ 第4章 タンパク質相互作用リンケージ解析法

【総括的タンパク質間相互作用解析法の現状と展望】
高橋信弘
 
【アフィニティーキャプチャーを利用した相互作用解析法】
1 エピトープ・タグを用いた
  グループ特異的沈降法による相互作用解析法
嶋本 顕 柳田光昭

2 リン酸化ペプチドを用いた解析
三浦賢司
【カラムスイッチング技術を利用した相互作用解析法】
瀬田和夫 John Peltier George Vella
 
BIA-MSによる相互作用解析法】
夏目 徹
 
【バイオインフォマティクスによる相互作用解析法】
1 構造生物学からのアプローチ

古谷利夫

2 構造ゲノム学からのアプローチ

木下賢吾 中村春木

■ 第5章 プロテオームデータベース

【プロテオームデータベースの現状と課題】
真鍋 敬
 
【プロテオームデータベース作成法】
戸田年総
 

■ 第6章 生命科学研究への応用

【ゲノム解析完了微生物と高等植物へのプロテオーム解析の適用】
1 枯草菌のプロテオーム解析
中山建男 高松宏治 渡部一仁 山根國男 
竹内道雄 朝井 計 笠原康裕 小林和夫 小笠原直毅

2 ラン藻のプロテオーム解析
佐塚隆志
3 線虫のプロテオーム解析
梶 裕之
4 植物のプロテオーム解析
梶原英之
【プロテオミクスを用いた細胞内情報解析と医学・薬学への応用】
1 発生過程のプロテオーム解析
深見泰夫

2 小脳形成期のプロテオーム解析
田岡万悟 礒辺俊明
3 アルツハイマー病のプロテオーム解析
辻 輝之 下濱 俊
4 細胞老化および不死化における研究
杉本正信 戸田年総
5 創薬の戦略としてのプロテオーム解析
a)サロゲートの同定から薬理プロテオミクスまで
西村俊秀

b)細胞膜タンパク質のプロテオーム解析
門屋利彦

■ 第7章 プロテオーム解析技術の将来

【自動化とマイクロフルイディスク】
Walter Blackstock 西村俊秀


■ 索引


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