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実験医学別冊　Experimental Medicine

達人直伝 マイクロバイオーム研究実践プロトコール サンプル調製やデータ解析で陥りがちなピットフォールを攻略し、ヒト微生物叢の本来の姿を捉える				◆　出版社　◆　羊土社 〒101-0052 東京都千代田区神田小川町2-5-1 TEL 03-5282-1211 FAX 03-5282-1212 URL https://www.yodosha.co.jp/

服部正平／編

■　序

【服部正平】

■　1章　マイクロバイオーム研究をはじめる前に考えること

1. ヒトマイクロバイオーム研究の全体像
   【服部正平】
   
   
2. データベースの意義とその整備
   【黒川　顕】
   
   
3. 細菌の分類と命名
   【坂本光央】
   

■　2章　腸内微生物叢のマイクロバイオームデータの生産

1. 微生物叢DNAの抽出技術の開発状況および酵素法プロトコール
   【服部正平，小宮恵子】
   
   
2. 腸内細菌叢DNAの抽出技術（ビーズ法プロトコール）およびライブラリ調製
   【関口勇地】
   
   
3. 腸内細菌叢を対象とした16S rRNA遺伝子のアンプリコンとメタゲノムの情報解析
   【森　宙史】
   
   
4. 腸内常在性ファージの解析・宿主細菌との相互作用
   【藤本康介，植松　智】
   
   
5. 腸内環境の代謝オミクス分析・解析
   【舟橋和毅，池田和貴】
   
   
6. 腸内真菌叢のマイクロバイオーム解析
   【秋山慎太郎，西嶋　傑，永田尚義】
   

■　3章　その他の微生物叢のマイクロバイオームデータの生産

1. 皮膚細菌叢のマイクロバイオーム解析
   【松岡悠美】
   
   
2. 唾液微生物叢のショットガンメタゲノム解析
   【矢原耕史】
   
   
3. ロングリードを用いたヒトマイクロバイオームの染色体外エレメントの解析
   【木口悠也，鈴木　穣】
   
   
4. 古代サンプルのマイクロバイオーム解析
   【澤藤りかい】
   

■　4章　細菌株の性質の解析

1. 菌株単離・培養と選定・釣菌，保存
   【成島聖子，坂本光央】
   

■　5章　マイクロバイオームデータの関連解析

1. ヒト遺伝子一塩基多型（SNP）とマイクロバイオームの関連解析
   【北岡寛己，友藤嘉彦，岡田随象】
   
   
2. 環境因子（食事，生活習慣，薬剤）や疾患とヒトマイクロバイオームの関連解析
   【西嶋　傑，永田尚義】
   

■　達人への一歩

1. 定期的な精度管理を，その1
   【関口勇地】
   
   
2. 定期的な精度管理を，その2
   【関口勇地】
   
   
3. 定期的な精度管理を，その3
   【関口勇地】
   
   
4. ウイルス（ファージ）叢の構成比について
   【藤本康介，植松　智】
   
   
5. メタゲノムデータのなかから真核生物由来のDNAを検出する手法
   【西嶋　傑】
   
   
6. 古代DNA解析への道のり
   【澤藤りかい】