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実験医学別冊 Experimental Medicine |
| AlphaFold時代の 構造バイオインフォマティクス実践ガイド 今日からできる！構造データの基本操作から相互作用の推定、タンパク質デザインまで |
◆ 出版社 ◆ 羊土社 〒101-0052 東京都千代田区神田小川町2-5-1 TEL 03-5282-1211 FAX 03-5282-1212 URL https://www.yodosha.co.jp/ |
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富井健太郎／編
| ■ 序 |
【富井健太郎】
| ■ 第1章 概論と基礎知識 |
- 構造バイオインフォマティクスへの招待
【富井健太郎】
- AlphaFold2の衝撃
【大上雅史】
- AlphaFoldの予測構造を読み解くための基礎知識
【西 羽美】
| ■ 第2章 立体構造データの入手と可視化・簡易計測 |
- 立体構造データの可視化と解析のためのツール
【山守 優】
- 各種立体構造データベースの種類と使い方
【于 健，栗栖源嗣】
- タンパク質の立体構造予測 〜ColabFoldとAlphaFold2〜
【森脇由隆】
| ■ 第3章 立体構造によるタンパク質の機能推定 |
- タンパク質-タンパク質の相互作用予測 〜AlphaFold-MultimerとAlphaFold3〜
【森脇由隆】
- 分子ドッキング法 〜タンパク質-化合物複合体の構造予測〜
【石谷隆一郎，力丸健太郎】
- MDシミュレーション 〜予測構造モデルの安定性や結合の強さを検証する〜
【寺田 透】
- 構造比較 〜立体構造を検索して比較する〜
【木原大亮】
| ■ 第4章 応用・発展的研究 |
- タンパク質の構造変化予測 〜AlphaFoldと分子動力学の統合〜
【岡崎圭一，大貫 隼】
- タンパク質デザインAIの動向と利用のコツ
【小林直也】
- AlphaMissenseによる変異導入効果予測 〜タンパク質言語モデルと立体構造予測の融合
【山口秀輝，齋藤 裕】
| ■ 索引 |
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