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実験医学別冊　Experimental Medicine

論文図表を読む作法 はじめて出会う実験＆解析法も正しく解釈！生命科学・医学論文をスラスラ読むためのFigure事典				◆　出版社　◆　羊土社 〒101-0052 東京都千代田区神田小川町2-5-1 TEL 03-5282-1211 FAX 03-5282-1212 URL https://www.yodosha.co.jp/

牛島俊和，中山敬一／編

■　序

【牛島俊和，中山敬一】

■　第1章　色々な解析に使えるエッセンシャル

【編集協力：島村徹平】

1. 統計的仮説検定とp値
   
   
2. 多重比較と多重検定補正
   
   
3. 信頼区間
   
   
4. t検定
   
   
5. ANOVA
   
   
6. 棒グラフ
   
   
7. 相関解析
   
   
8. 線形回帰
   
   
9. カーブフィッティング
   

■　第2章　核酸解析

【編集：牛島俊和】

1. バイオアナライザ・TapeStationとRIN値・DIN値
   
   
2. アガロースゲル電気泳動
   
   
3. PCR／RT-PCR
   
   
4. 定量的PCR
   
   
5. デジタルPCR
   
   
6. バイサルファイトシークエンス
   
   
7. G分染法
   
   
8. DNA-FISH解析
   
   
9. 間期核FISH解析
   
   
10. Promoterアッセイ
    
    
11. Gel Shiftアッセイ
    

■　第3章　細胞の形態や性質の解析

【編集協力：金田篤志】

1. 免疫組織化学
   
   
2. 蛍光染色
   
   
3. 走査電子顕微鏡
   
   
4. 透過電子顕微鏡
   
   
5. 細胞増殖アッセイ
   
   
6. フローサイトメトリー
   
   
7. 細胞周期
   
   
8. Annexin �X assay／Sub-G1 assay
   
   
9. TUNEL assay／Comet assay
   
   
10. 薬剤感受性試験
    
    
11. 細胞運動能アッセイ
    
    
12. Oil Red O染色
    
    
13. 3D culture
    
    
14. 造腫瘍性（同種・異種移植実験）
    
    
15. 細胞老化
    

■　第4章　タンパク質解析

【編集：中山敬一】

1. ポリアクリルアミド電気泳動
   
   
2. Western blot
   
   
3. 二次元電気泳動
   
   
4. FRET
   
   
5. タンパク質半減期測定
   
   
6. ユビキチン化アッセイ
   
   
7. オーキシンデグロン法
   
   
8. PROTAC
   
   
9. Fluoppi
   
   
10. BiFC／SplitGFP
    
    
11. インターラクトーム解析
    
    
12. ELISA法
    
    
13. IP／RIP
    
    
14. カラムクロマトグラフィー
    
    
15. ショットガンプロテオミクス
    
    
16. ターゲットプロテオミクス
    
    
17. 結晶構造解析
    
    
18. クライオ単粒子解析
    
    
19. NMR解析
    
    
20. 表面プラズモン共鳴法
    
    
21. 等温滴定型カロリメトリー
    
    
22. Phos-tag
    
    
23. インビトロヘリカーゼアッセイ
    
    
24. ショ糖密度勾配遠心法
    
    
25. 高速AFM
    

■　第5章　代謝解析

【編集協力：尾池雄一】

1. リピドミクス
   
   
2. 細胞外フラックス解析
   
   
3. 高血糖クランプ／高インスリン正常血糖クランプ
   
   
4. ブドウ糖負荷試験／インスリン負荷試験
   
   
5. メタボローム解析／代謝フラックス解析
   
   
6. 代謝ケージによるマウス代謝測定
   
   
7. 寒冷刺激試験
   

■　第6章　実験動物・遺伝子改変動物解析

【編集：中山敬一】

1. CT
   
   
2. MRI
   
   
3. PET／SPECT
   
   
4. 光イメージング
   
   
5. Cre/loxPシステム
   
   
6. 遺伝学的系統追跡
   
   
7. 電気生理学的手法
   
   
8. 覚醒下脳イメージング
   
   
9. 光遺伝学
   
   
10. オープンフィールド試験
    
    
11. モリス水迷路試験
    
    
12. Three-Chamber test
    

■　第7章　NGSなどを用いた網羅的解析

【編集協力：兒島孝明】

共通

1. マイクロアレイ
   
   
2. Volcano plot
   
   
3. Pairwise scatter plot
   
   
4. Gene ontology解析
   
   
5. 階層的クラスタリング
   
   
6. k-meansクラスター解析
   
   
7. PCA
   
   
8. メタジーン解析
   
   
9. モチーフ図
   
   
10. STRING（ネットワーク解析）
    
    
11. KEGG pathway
    
    
12. ネットワーク解析
    

変異とSNP（GWAS）

13. 変異シグネチャー
    
    
14. Circos plot
    
    
15. Manhattan plot
    
    
16. Regional plot
    
    
17. ハプロタイプ
    
    
18. Accumulation curve
    

発現

19. MA plot（RNA-seq）
    
    
20. t-SNE／UMAP（シングルセルRNA-seq）
    
    
21. Trajectory 解析／Pseudotime解析
    
    
22. RNA velocity解析
    
    
23. TCR/BCRレパトア解析
    
    
24. Ribo-seq
    

エピゲノム解析

25. ChIP-seq
    
    
26. ATAC-seq
    
    
27. Hi-C
    

■　第8章　マイクロバイオーム・メタゲノム解析

【編集協力：長谷耕二】

1. 16SリボソームRNA配列解析
   
   
2. ショットガン・メタゲノム解析
   
   
3. 注釈付き系統樹
   
   
4. α多様性解析
   
   
5. β多様性解析
   

■　第9章　臨床情報解析

【編集協力：山本精一郎】

1. Kaplan-Meier法
   
   
2. ROC曲線
   
   
3. 多変量解析
   
   
4. メタアナリシス
   

■　索引

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