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実験医学別冊 Experimental Medicine |
| ロングリードWET&DRY解析ガイド シークエンスをもっと自由に！ リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de novoアセンブリまで、研究の可能性をグンと広げる応用自在な最新技術 |
◆ 出版社 ◆ 羊土社 〒101-0052 東京都千代田区神田小川町2-5-1 TEL 03-5282-1211 FAX 03-5282-1212 URL https://www.yodosha.co.jp/ |
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荒川和晴，宮本真理／編
| ■ 序 |
【荒川和晴，宮本真理】
| ■ 第1章 Introduction |
- 序論：誰もがゲノムシークエンシングできる時代に
【荒川和晴】
- ナノポアシークエンスの原理と技術発展
【宮本真理】
- DRY解析環境のセットアップとデータ解析プラットフォームGalaxyの使い方
【大田達郎，志波 優】
- ナノポアシークエンス実践ガイド ～ライブラリプレップから解析環境選びまで
【上村泰央】
| ■ 第2章 プロトコール(1) リピートと構造変異 |
- 動物の長鎖リピート解析（クモ糸を例に）
【河野暢明】
- ヒト疾患関連の長鎖リピート解析
【三橋里美】
- ヒト疾患関連のSV解析
【坂本祥駿，三宅修平，岡 実穂，鈴木 穣，鈴木絢子】
- 核酸の塩基修飾解析
【古田芳一】
- メガベースをめざせ！ultra-long readプロトコール
【中村浩之，河野暢明，荒川和晴】
| ■ 第3章 プロトコール(2) ゲノムアセンブリ |
- 初めてでもできる！細菌ゲノムのアセンブル
【谷口 誠】
- 和牛のde novoゲノムアセンブリ
【若栗浩幸，今村聖実，佐々木慎二，鈴木 穣】
- ナノポアで読む植物ゲノム
【内藤 健】
| ■ 第4章 発展的アプリケーション |
- direct RNA sequenceとRNA修飾の情報解析
【上田宏生】
- ナノポア技術によるオンサイト迅速細菌同定
【松尾禎之】
- ナノポアシークエンサーMinIONを活用したウイルス解析
【中川 草】
| ■ 索引 |
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