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実験医学別冊 Experimental Medicine |
| エピジェネティクス実験スタンダード もう悩まない！ ゲノム機能制御の読み解き方 |
◆ 出版社 ◆ 羊土社 〒101-0052 東京都千代田区神田小川町2-5-1 TEL 03-5282-1211 FAX 03-5282-1212 URL https://www.yodosha.co.jp/ |
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牛島俊和，眞貝洋一，塩見春彦／編
はじめに
【牛島俊和，眞貝洋一，塩見春彦】
| I エピジェネティクス解析ナビ |
- DNAメチル化解析ナビ
【牛島俊和】
- ヒストン化学修飾解析ナビ
【眞貝洋一】
- エピゲノム制御因子としての非コードRNA解析ナビ
【塩見春彦】
| II DNAメチル化解析 |
A 個別領域の解析
- 領域特異的バイサルファイトシークエンシング
【前之原章司，鵜木元香】
- メチル化特異的PCR法
【竹島秀幸，牛島俊和】
- 制限酵素によるDNAメチル化検出
【新沼 猛，鈴木 拓】
- パイロシークエンス法 複数のCpGメチル化の定量
【新城恵子，近藤 豊】
- MassARRAYを用いたメチル化解析
【高根希世子，八木浩一，金田篤志】
- DNAメチル化酵素活性の解析
【末武 勲，三島優一，高橋沙央里，古川亜矢子】
- 5-ヒドロキシメチルシトシンの解析 DNA免疫沈降-リアルタイムPCR（DIP-qPCR）
【山口新平】
- DNA脱メチル化剤とHDAC阻害剤の処理
【服部奈緒子，牛島俊和】
B 網羅的解析
- Infinium
【山下 聡，飯田直子，服部奈緒子，竹島秀幸，牛島俊和】
- PBAT法によるメチローム解析
【三浦史仁，伊藤隆司】
- MeDIP-Seq法：メチルシトシン抗体による免疫沈降法
【永江玄太】
| III ヒストン化学修飾解析 |
A 全体像の解析
- ヒストン修飾抗体を用いたウエスタンブロット解析
【立花 誠】
- ヒストン修飾のイメージング
【木村 宏】
B 個別領域の解析
- クロマチン免疫沈降（ChIP）法
【加藤雅紀，眞貝洋一】
C 網羅的解析
- ChIP-Seq
【加藤由起，坂東優篤，白髭克彦】
- エピゲノムデータベースの現状と活用
【渡辺 亮，中村正裕，岡田千尋】
D 酵素活性の測定
- HDAC活性・HAT活性測定法
【伊藤昭博，中田明子，吉田 稔】
- 再構成ヌクレオソームを用いたヒストンメチル化活性測定
【浦 聖惠】
- ヒストン脱メチル化活性測定法 FDH-coupled assay
【合田 哲】
- ヒストンのリン酸化・ユビキチン化活性測定法
【島田 緑，中西 真】
| IV 非コードRNA解析 |
A 長分子RNAの解析
- 既知タンパク質に結合するRNAの網羅的解析手法 FAST-iCLIP
【石津大嗣】
- lncRNAが結合するタンパク質・RNA・DNAの網羅的解析 ChIRP（chromatin isolation by RNA purification）
【小野口真広】
- lncRNA複合体の細胞内局在と構造解析
【中川真一】
- lncRNAの遺伝学的解析
【中島達郎，酒田祐佳，佐渡 敬】
B 小分子RNAの解析
- 内在性小分子RNAの網羅的解析手法
【岩崎由香】
| V．核内高次構造解析 |
- ヌクレオソーム解析（FAIRE-Seq）
【脇 裕典，堤 修一】
- 3C・4C法によるクロマチン高次構造解析
【石原 宏，中尾光善】
| VI その他の新技術 |
- エピゲノム編集
【佐久間哲史，中出翔太，山本 卓】
- シングルセル解析
【鹿島幸恵，鈴木絢子，関 真秀，鈴木 穣】
- クロマチンに結合するタンパク質の網羅的解析 ラベルフリー定量法を用いたChEPなど
【足立 淳】
- 特定のクロマチン領域に結合するタンパク質の網羅的解析 PICh法など
【井手 聖】
- メチル化酵素の新規標的分子の網羅的解析
【島津忠広，五月女宜裕，袖岡幹子，眞貝洋一】
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