1. 基礎から学ぶ統計学
2. 生化学実験
3. 小説みたいに楽しく読める免疫学講義
基礎から学ぶ
統計学
中原 治／著
本書の使い方
統計学を学ぶ心がけ／予備知識／本書の学び方／のんびり取り組む／本書の難所／練習問題を解く／数学が得意なら／ご協力ください
序章 はじめに
1．統計学の必要性
2．散らばり（バラツキ）
3．基本的な用語と概念
（1）観測値と標本（2）母集団（3）統計学の目的（4）統計学の理論を支える土台（5）単純無作為標本
4．本書の２本柱
（1）平均の比較（2）2変数の関係
5．検定統計量
第I部 統計的仮説検定の論理
1章 検定の論理（二項検定を教材として）
1．例題1：B薬はA薬より有効か？
（1）例題1.1：18人に効果がある場合（2）例題1.2：14人に効果がある場合（3）例題の解答
2．二項分布
（1）二項係数 nCx（2）コブ斜面を降りる（3）ゴール2へ降りる確率（4）二項分布（5）二項分布の応用
3．期待値 E[X]
4．練習問題 A
5．二項検定
（1）STEP1：帰無仮説H0と対立仮説HA（2）STEP2：検定統計量（3）STEP3：帰無分布（4）二項分布の特徴（5）STEP4：棄却域と有意水準（6）STEP5：有意差の有無の判断
6．検定の論理（まとめ）
7．練習問題 B
2章 検定統計量（Wilcoxon-Mann-Whitney検定を教材として）
1．例題2：肥料Aと肥料Bの収量に差はあるか？
（1）栽培実験（2）基本的な用語と記号
2．WMW検定の目的
（1）2つの母集団（2）2つの標本（3）2つの可能性
3．検定統計量
4．WMW検定の手順
（1）帰無仮説H0と対立仮説HA（2）ノンパラメトリック統計（3）WMW検定の手順（4）STEP1：検定統計量Uの計算（5）Uの定義（6）STEP 2：Uの臨界値U0.05（7）STEP3：有意差の有無の判断
5．練習問題 C
6．数学者たちに感謝
7．WMW検定の定性的理解
（1）可能な結果の全て（2）検定統計量Uの性質（3）帰無分布（4）棄却域
8．WMW検定の実践的な技術
（1）標本サイズnが大きい場合のU1とU2の計算（2）タイ（等しい値）がある場合のUの計算
9．WMW検定を発明した自然科学者たち
（1）Frank Wilcoxon（2）Henry Berthold Mann と Donald Ransom Whitney
10．統計学を学ぶための心がけ
11．WMW検定の手順（まとめ）
12．練習問題 D
3章 第1種の過誤と第2種の過誤
1．検定の論理の復習
（1）二項検定の復習（2）説明のスタイル
2．4つの可能性
3．第1種の過誤
（1）帰無仮説H0が間違っているとき（2）帰無仮説H0が正しいときの「有意差なし」（3）帰無仮説H0が正しいときの「有意差あり（P<0.05）」（4）「有意差あり（P<0.05）」の意味
4．第2種の過誤
（1）帰無仮説H0が正しいとき（2）帰無仮説H0が間違っているときの「有意差あり（P<0.05）」（3）帰無仮説H0が間違っているときの「有意差なし」（4）第1種の過誤と第2種の過誤の性質の違い（5）「有意差なし」は帰無仮説H0の証明ではない
5．データの解釈と言葉遣いに、気をつける
（1）「有意差あり（P<0.05）」のとき（2）「有意差なし」のとき
第II部 統計学の理論的基礎
4章 平均・分散・標準偏差・自由度
1．例題4：3つの観測値
2．母集団と標本
3．平均
（1）母平均μ（算術平均）（2）母平均μ（期待値）（3）標本平均■ ④不偏推定量
4．分散と標準偏差の基礎
（1）μが既知だと仮定する（2）偏差（3）平均偏差（偏差を絶対値で正にする）（4）分散（偏差を2乗で正にする）（5）標準偏差
5．母分散σ 2と母標準偏差σ
（1）偏差と偏差平方和SS（2）母分散σ2（算術平均）（3）母分散σ2（期待値）（4）母標準偏差σ
6．標本分散s2と標本標準偏差s
（1）偏差の起点に代役を使う（2）偏差平方和SSと自由度df
7．母数と統計量
（1）母数（2）統計量
8．自由度dfの概念を確立してきた自然科学者たち
（1）Friedrich Bessel（2）Ronald Aylmer Fisher
9．自由度df
（1）制約条件と自由度（2）偏差に課された制約条件（3）統計学における自由度の意味
10．標本分散s2の計算の手順（まとめ）
11．練習問題 E
5章 正規分布と統計理論の初歩
1．正規分布
（1）二項分布から正規分布へ（2）確率密度（3）母数（パラメータ）（4）±σ・± 2 σ・± 3 σの範囲
2．標準正規分布
（1）μ =0 でσ =1 の正規分布（2）標準正規分布表（3）臨界値 z0.05
3．練習問題 F
4．標準化
（1）標準化の簡単な例題（2）標準化の視覚的な理解（3）標準化して得たzが従う確率分布
5．練習問題 G
6．定理1：標本平均が従う確率分布
（1）標本平均は散らばりが小さい（2）散らばりが小さくなる理由（3）標本平均■が従う確率分布（4）大数の法則（5）標本分布と標準誤差
7．練習問題 H
8．定理2：中心極限定理
9．定理3：正規分布の再生性
10．練習問題 I
11．定理4：2つの標本平均の差が従う確率分布
12．練習問題 J
13．定理（まとめ）
6章 t分布と母平均μの95% 信頼区間
1．例題6：7つの観測値の背後にいる母平均μは？
2．母標準偏差σが既知の場合の95% 信頼区間
（1）前提条件（2）標本平均の確率分布（3）標本平均の標準化（4）σが既知の95% 信頼区間（5）例題の解答（σが既知の場合）
3．練習問題 K
4．σをsで代用してみる
（1）σはsで代用するしかないが（2）σをsで代用した標準化
5．Gosset が発明したt分布
（1）Karl Pearson（2）William Sealy Gosset
6．標準化とStudent 化（まとめ）
7．t分布の定性的理解
（1）t分布は背が低くて幅が広い（2）t分布は標本サイズnによって形が少しずつ変化する（3）母数（パラメータ）は自由度df（4）臨界値 t0.05（df）
8．母標準偏差σが未知の場合の95% 信頼区間
（1）公式の導出（2）例題の解答（σが未知の場合）
9．95% 信頼区間の「95%」の意味
10．母平均μの95% 信頼区間の手順（まとめ）
11．練習問題 L
第III部 母平均μに対する統計解析
7章 関連2群のt検定（対応のあるt検定）
1．関連2群（対応のあるデータ）の特徴
（1）例題7.1：サプリメントの効果（2）例題7.2：肥料の効果
2．対応する2つの観測値の差d
（1）観測値の差に注目（2）2つの可能性
3．帰無仮説H0と対立仮説HA
（1）前提条件（2）帰無仮説H0と対立仮説HA
4．σ dが既知の場合
（1）検定統計量と帰無分布（2）例題の解答（σ dが既知の場合）
5．練習問題 M
6．σ dが未知の場合
（1）検定統計量tと帰無分布（2）関連2群のt検定の手順（まとめ）（3）例題の解答（σ dが未知の場合）
7．練習問題 N
8．検定統計量tの定性的理解（3つの判断基準）
（1）差dの標本平均の効果（2）差dの標本標準偏差の効果（3）標本サイズの効果
9．検定統計量tの性質（まとめ）
8章 独立2群のt検定（対応のないt検定）
1．独立2群（対応のないデータ）の特徴
（1）例題8.1：サプリメントの効果（2）例題8.2：精神障害
2．標本平均の差
（1）2つの可能性（2）独立2群のt検定の前提条件（3）標本平均の差の確率分布
3．帰無仮説H0と対立仮説HA
4．σが既知の場合
（1）検定統計量zと帰無分布（2）例題の解答（σが既知の場合）
5．練習問題 O
6．σが未知の場合
（1）σの推定（その1）：2つの標本標準偏差（2）σの推定（その2）：合算標準偏差sp（3）検定統計量tと帰無分布（4）独立2群のt検定の手順（まとめ）（5）例題の解答（σが未知の場合）
7．練習問題 P
8．検定統計量tは煩雑
9．練習問題 Q：Studentのtをシンプルにする
10．検定統計量tの定性的理解（3つの判断基準）
（1）標本平均の差（2）標本標準偏差（3）標本サイズ
11．検定統計量tの性質（まとめ）
9章 P値
1．検定の枠組み
2．2 択だけの判断は不十分
（1）有意差がない場合（2）有意差がある場合
3．P値
（1）P値の定義（2）P値を得たら、まず0.05と比較する（3）例題8.1の場合（4）「有意差あり」の表記法（5）「有意差なし」の表記法
10章 一元配置分散分析
1．一元配置分散分析のデータの特徴
（1）例題10.1：サプリメントの効果（2）例題10.2：ニジマスに与える餌
2．2つの可能性
3．一元配置分散分析の前提条件
4．帰無仮説H0と対立仮説HA
5．新しい記号：k, N, ■
（1）標本の数（群）k（2）観測値の総数Nと総平均■
6．一元配置分散分析の大まかな流れ
（1）誤差平均平方（群内分散）MSwithin（2）処理平均平方（群間分散）MSbetween（3）全平均平方MStotal（4）分散分析表（5）検定統計量F
7．誤差平均平方（群内分散）MSwithin
（1）偏差平方和 SSwithin（2）自由度 dfwithin（3）誤差平均平方（群内分散）MSwithin
8．練習問題 R
9．処理平均平方（群間分散）MSbetween
（1）予備知識の復習（2）母分散σ 2の推定（3）処理平均平方（群間分散）MSbetween（4）偏差平方和SSbetweenと自由度dfbetween
10．練習問題 S
11．全平均平方 MStotal
12．練習問題 T
13．分散分析表と検定統計量F
14．検定統計量Fの定性的理解
（1）分母のMSwithinの役割（2）分子のMSbetweenの役割（3）例題10.1の場合（4）F分布と臨界値F0.05
15．一元配置分散分析の手順（まとめ）
16．練習問題 U
17．標本サイズが不揃いのときの計算
11章 多重比較（Bonferroni 補正とTukey-Kramer 法）
1．多重比較のデータの特徴
（1）例題11.1：サプリメントの効果（2）例題：11.2．ニジマスに与える餌
2．アルファベットを使った結果の表示
3．多重比較の出発点
4．多重性という課題
（1）帰無仮説H0が正しいとき（2）第1種の過誤と有意水準α（3）FWER（全体としての有意水準）（4）ライフルで的を狙う（5）多重性（まとめ）
5．Bonferroni 補正
（1）Bonferroni補正の方法（2）多重比較の欠点
6．Tukey-Kramer法
（1）Tukey-Kramer法の前提条件（2）帰無仮説H0と対立仮説HA（3）検定統計量q
7．Tukey-Kramer法の計算
（1）対戦表（2）検定統計量qの分子（3）検定統計量qの分母（4）検定統計量q（5）臨界値q0.05（k,dfwithin）
8．Tukey-Kramer法の手順（まとめ）
9．アルファベットの割り当て
（1）割り当ての方法（2）アルファベットの役割（まとめ）
10．練習問題 V
第IV部 2つの変数x とy の間の関係
12章 相関分析
1．例題12：2つの変数の関係は？
（1）例題12.1：かき氷の売上と気温（2）例題12.2：ホタルと農薬
2．新しい記号：（xi, yi）
3．正の相関と負の相関
4．強い相関と弱い相関
5．相関係数rの性質
6．標本共分散sxy
（1）偏差の積（2）偏差の積の和（3）自由度（4）共分散の性質（その1）：無相関のとき（5）共分散の性質（その2）：正の相関があるとき（6）共分散の性質（その3）：負の相関があるとき
7．相関係数r
（1）共分散sxyは単位に依存する（2）sxyを標準偏差sxとsyで割る理由
8．相関係数rの計算
9．練習問題W
10．相関の検定
（1）相関分析の前提条件（2）母相関係数ρ（3）帰無仮説H0と対立仮説HA（4）検定統計量tと帰無分布（5）例題12.1 の解答
11．より簡便な検定方法
12．練習問題 X
13．線形 vs. 非線形（相関係数rの苦手な状況）
14．対数変換
（1）実例（その1）：北海道の湖沼（2）実例（その2）：ガラパゴス諸島
15．Spearman の順位相関係数
（1）順位で散布図を描く（2）順位相関係数rsの計算
16．相関は因果関係の証明にはならない
13章 単回帰分析
1．例題13：他の変数から予測できるか？
（1）例題13.1：かき氷の売上と気温（2）例題13.2：定量実験における基本的な作業
2．単回帰分析の前提条件
3．最小2乗法
4．回帰直線の性質
（1）回帰直線が通る点（2）回帰直線の傾き
5．xとyを逆にしない
6．y-切片aと傾きbの計算
7．内挿と外挿
8．決定係数 r2
（1）全平方和 SStotal（2）残差平方和 SSresidual（3）回帰平方和 SSregression（4）回帰の恒等式（5）決定係数（その1）：一般的な定義（6）決定係数（その2）：もう1つの定義（7）決定係数（その3）：実際の計算方法
9．練習問題 Y
10．単回帰分析における検定と推定
（1）計算に必要な2つの統計量SSxとMSresidual（2）傾きbの必要性を確認する検定（3）母回帰係数βの95% 信頼区間（4）条件付き期待値E[y|x] の95% 信頼区間（信頼帯）（5）観測値y の95% 予測区間（予測帯）
付録 解答と付表
解答
付表
索引
Column
●片側検定は要注意！
● レポートや学術論文、研究につなぐ
● 期待値を使った母平均μをもう少し詳しく
● 「不偏分散」という隠語
● 離散型と連続型の母平均μと母分数σ2の定義
● 別々の偏差平方和を計算する理由
● 合算標準偏差spのもう１つの定義式
● SSwithinの実際の計算
● SSbetweenの実際の計算
● SStotalの実際の計算
栄養科学イラストレイテッド
生化学実験
鈴木敏和，杉浦千佳子，高野 栞／著
序
【鈴木敏和】
動画
【高野 栞】
第1章 生化学実験をはじめる前に
【鈴木敏和】
1 生化学実験を行う意義
2 安全に実験を行うために
A 服装など
B 実験前
C 実験中
D 実験終了後
E 緊急時または災害時の対応
3 生化学実験で使用する水について
4 生化学実験で使用する単位，有効数字
A 質量パーセント濃度（％）
B モル（mol）
C モル濃度（体積モル濃度，mol/L）
D 規程度（N）
E pH（水素イオン指数）
F 体積質量濃度（g/L, μg/mL など），ユニット濃度（U/mL など）
G 有効数字
5 実験記録とレポートの書き方
A 実験実習で持参するもの
B 実験記録
C レポート
第2章 基本操作
【鈴木敏和】
1 マイクロピペットの操作方法
A 容量設定
B 吸入（フォワード法）
C 排出
D 参考
2 ビュレットの操作方法
3 その他の実験器具の使用方法で参考となるサイト
第3章 中和滴定
【鈴木敏和】
1 滴定とは
2 酸および塩基とは
3 中和とは
実験3-1 食酢の中和滴定
第4章 緩衝液
【鈴木敏和】
1 緩衝液とは
2 緩衝液のpHの求め方
3 アミノ酸の性質
実験4-1 緩衝液の性質
実験4-2 アミノ酸の滴定によるpH緩衝作用の観察
第5章 タンパク質の等電点
【鈴木敏和】
1 タンパク質の等電点
実験5-1 タンパク質水溶液のpHを変化させたときの状態観察
第6章 吸光光度分析（比色定量法）
【鈴木敏和】
1 色について
2 吸光光度分析について
実験6-1 合成着色料の比色定量
第7章 酵素の性質
【鈴木敏和】
1 酵素とは
2 酵素反応
実験7-1 西洋わさびペルオキシダーゼ（HRP）活性の観察
実験7-2 ウレアーゼの反応速度に及ぼす酵素および基質濃度の効果
実験7-3 ウレアーゼの反応速度に及ぼす阻害剤の効果
第8章 酵素分析法による生体成分の分析
【鈴木敏和】
1 酵素分析法とは
実験8-1 GOD-POD法とインベルターゼを利用した，清涼飲料水に含まれる糖の定量
第9章 細胞分画法
【杉浦千佳子】
1 細胞と細胞小器官
実験9-1 ニワトリの肝臓から細胞小器官の分離
実験9-2 核画分の定性―DNAの確認―
実験9-3 ミトコンドリア画分の定性
第10章 DNAの性質
【杉浦千佳子】
1 核酸とは
実験10-1 ニワトリの肝臓からのDNA抽出および純度の測定
実験10-2 DNAの定量
実験10-3 DNAの化学的性質
第11章 PCRと制限酵素
【鈴木敏和】
1 PCRとは
2 制限酵素とは
3 PCRの原理
A PCR
B 制限酵素
C 制限酵素断片長多型法
実験11-1 PCRと制限酵素を使用したALDH2遺伝子多型の検出とアルコール感受性
第12章 抗原抗体反応
【鈴木敏和】
1 免疫とは
2 抗体反応の応用
実験12-1 ELISA法による抗原の検出
第13章 生体分子の分離・分析
【鈴木敏和】
1 混合物からの物質の分離
2 カラムクロマトグラフィー
3 SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動（SDS-PAGE）
実験13-1 CM-セファロースカラムを用いたタンパク質の分離
実験13-2 SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動によるタンパク質の展開
第14章 ビタミンCの定量と抗酸化活性
1 ビタミンCの性質
【鈴木敏和】
2 ビタミンCの定量
【鈴木敏和】
3 抗酸化機構
【杉浦千佳子】
実験14-1 モリブデンブルー発色法による食品のビタミンC定量
【鈴木敏和】
実験14-2 ビタミンCの抗酸化活性 ―DPPHラジカル消去活性の測定―
【杉浦千佳子】
索引
小説みたいに楽しく読める
免疫学講義
小安重夫／著
はじめに
序章 新型コロナウイルスと戦う免疫を知ろう
第1章 それは伝染病からはじまった
1 伝染病と二度なし―獲得免疫
2 生まれつきもっている武器―自然免疫
3 免疫はよいことばかりじゃない―アレルギー
4 小児科医の大きな貢献
第2章 免疫の謎に挑んだ偉大な先人たち
1 二度なしのしくみの考察
2 一卵性双生児でも免疫は同じではない―柔軟なシステム
3 パズルへの挑戦―謎解きのはじまり
第3章 解き明かされた数々の謎
1 数多くのウイルスや細菌と戦える理由―特異性と多様性のしくみ
2 自分を自分とわかるのはなぜだろう―拒絶反応のからくり
第4章 免疫はものを見分ける
1 目立つ異物を見つけ出す方法
2 目立たない異物まで見つけ出す方法―遺伝子を組換えてできるリンパ球の目
第5章 自分が自分とわかる仕掛け
1 入学は楽だけど卒業が難しい胸腺大学―自己寛容の秘密
2 自分を攻撃しないための第二・第三の策略
第6章 免疫の登場人物とその履歴
1 外敵と戦う戦士たち―多彩な顔つきの白血球と自然免疫
2 免疫の隠れた司令塔―樹状細胞とリンパ組織
3 分子ミサイル「抗体」の誕生―液性免疫
4 ツベルクリン検査が教えるもう一つの戦い方―細胞性免疫
5 リンパ球の役割分担―二一世紀になって見つかった（！）自然リンパ球
7章 病気と免疫
1 感染症を予防するワクチン
2 免疫は両刃の剣―アレルギーと自己免疫疾患
3 ゲノムが教える病気との関係
4 臓器移植と再生医療
5 がんは免疫で治る時代が来た
6 微生物の逆襲―エイズウイルスの驚きの戦略
終章 残された疑問：まだまだわからないこと
あとがき
参考図書
免疫のしくみを明らかにしたさまざまな発見の年表
さくいん
コラム
(1)細菌の分離培養とコッホの三原則
(2)インターフェロンの命名
(3)注目されなかったグリックの研究
(4)制限酵素からCRISPR-Cas9：細菌の免疫！
(5)ヤーネと利根川
(6)部外者にはややこしいＣＤ分子の命名法A
(7)ＮＫ細胞と潜水艦？
(8)インターロイキンの命名法
(9)Ｆａｓの思い出
(10)免疫学者の有名な背中
(11)山中のｉＰＳ細胞
![バイオウェブ - [HOME]](../../../images/home01.gif)