1. 撃ち落とされたエイズの巨星
2. RNA-Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ
撃ち落とされたエイズの巨星
HIV/AIDS撲滅をめざしたユップ・ランゲ博士の闘い
シーマ・ヤスミン，Seema Yasmin／著，鴨志田 恵／翻訳
序文ーメイベル・ファン・オラニエ妃
この本が生まれたいきさつ
第一章 終焉
第二章 ことのはじまり
第三章 謎の感染症
第四章 敵を知れ
第五章 異色の官僚
第六章 さまざまな臨床試験
第七章 エイズ否認論の出現
第八章 エイズ活動家たち
第九章 お金と信念
第一〇章 治癒にむけて
エピローグ
謝辞
RNA-Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ
坊農秀雅／編
序文（本書の編集方針）
Annual UpdateとWeb Supplementについて
Chapter1 まずはこれだけ！解析環境を整える～Mac＋Biocondaを中心に
【安水良明】
Chapter2 データを入手する
（1）RNA-Seqの注意点～外注時のリード数，小分子・長分子での違いなど
【木本舞】
COLUMN RNA-Seq vs マイクロアレイ
【石井善幸】
（2）公共データの利用～AOEとRefEx，SRAデータ取得，メタ解析
【坊農秀雅】
Chapter3 転写産物の発現を定量する
（1）リファレンスゲノムにマッピングする方法①～HISAT2 + StringTie
【安藤美波，粕川雄也】
（2）リファレンスゲノムにマッピングする方法②～STAR + RSEM
【上樂明也】
COLUMN Strand NGS～RNA-SeqデータをGUIで解析する
【田中英夫】
（3）リファレンスゲノムにマッピングしない方法～salmon，kallisto，tximport & RNA-Seq定量にまつわるFAQ
【露﨑弘毅】
（4）転写開始点を解析する方法～CAGE
【森岡勝樹】
COLUMN 各種ツールの実行時間比較
【丹下正一朗】
Chapter4 リファレンスゲノムのない生物でde novo解析を行う
【横井翔】
Chapter5 発現変動遺伝子群を検出する
【門田幸二】
Chapter6 サンプル間の発現変動した遺伝子群の機能を推定する～エンリッチメント解析
【仲里猛留】
COLUMN Ingenuity Pathway Analysis～発現プロファイルの生物学的意義をGUIで解析する
【執筆／Stuart Tugendreich，Jean-Noel Billaud，訳／國田竜太】
COLUMN アノテーション情報とID変換～Gene Ontology，BioMart，Spotfire
【坊農秀雅】
Chapter7 多数のサンプル間の類似度を比較する～1細胞RNA-Seqの場合
（1）次元削減と可視化
【佐藤建太，二階堂愛】
（2）類似度の計算とクラスタリング
【佐藤建太，二階堂愛】
COLUMN 1細胞RNA-Seq解析の動向
【佐藤建太，二階堂愛】
Chapter8 リードカウント以降の統合解析をウェブブラウザで行う～iDEP
【上坂一馬】
Chapter9 論文投稿に必須！データを登録・公開する～DRA，GEA
【児玉悠一】
COLUMN 解析結果を論文発表する際にはここに気をつけよう
【坊農秀雅】
索引
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