バイオウェブ - プロテオミクス実験プロトコール

■　第4章　サンプルの脱塩法

I.　脱塩法の原理
II.　ナノカラムを自作する
III.　Zip Tipを用いた脱塩法
IV.　C18以外の担体と，様々な工夫

■　第5章　MALDI-TOF質量分析計による測定

I.　MALDI-TOF MSによる質量分析
II.　マススペクトルの評価

■　第6章　PMF法によるタンパク質同定，データベース検索

I.　ピークリストの作製
II.　代表的な検索サイトを利用した検索

■　第7章　Q-TOF型質量分析計によるマススペクトル測定，MS/MS測定

I.　ESI-Q-TOFによる質量分析
II.　測定の準備
III.　マススペクトルの測定
IV.　MS/MSスペクトルの測定
V.　キャリブレーション

■　第8章　キャピラリー高速液体クロマトグラフィー

I. 　キャピラリーHPLCの原理と実際

■　第9章　LC/MS/MS測定

I.　ナノスプレー・イオン源
II.　測定パラメーターの設定
III.　実際の自動LC/MS/MS測定

■　第10章　イオントラップを使ってみよう

I.　イオントラップ型質量分析計の原理
II.　ナノスプレー・イオン源
III.　測定準備
IV.　インフュージョンによるマススペクトルの測定
V.　LC/MSの測定

■　第11章　MS/MSスペクトルの解釈とシークエンスタグ

I.　スペクトルの処理
II.　MS/MSスペクトルからアミノ酸配列を読む
III.　ソフトウェアを使う

■　第12章　MS/MS解析によるデータベース検索

I.　MS/MSスペクトルからのピークリスト作成
II.　MS/MS解析からの，インターネットを介したデータベース検索
III.　自動検索ツール

■　第13章　タンパク質翻訳後修飾の解析

I.　プリカーサースキャン法の原理
II.　解析法の概要
III.　ネガティブモードでのMS測定
IV.　プリカーサースキャン
V.　ポジティブモードのMS/MS測定
VI.　LC/MSでのプリカーサースキャン

■　第14章　ディファレンシャル解析

I.　原理
II.　ラベル試薬による標識反応とトリプシン処理
III.　陽イオン交換樹脂カートリッジによる過剰試薬の除去
IV.　アビジンカラムによる標識ペプチド精製とビオチニル基の切断
V.　サンプルの脱塩とマススペクトルの測定

■　コラム

播磨プロテオミクス・サマースクール