バイオウェブ - バイオリソース＆データベース活用術

■　第1部バイオデータベース

1 MEDLINE PubMedを用いた基本的な文献検索
長谷川義和

紹介データベース
Genome Phenome Superbrain（GPS）

2 OMIM ヒト遺伝子と疾患のデータベース
高岡裕・松尾雅文

紹介データベース
ADSS（Acupoints Database Search System）

3 Ensembl Genome Browser ヨーロッパ発の代表的なゲノムブラウザ
菊野玲子

4 UCSC Genome Browser アメリカ発の代表的なゲノムブラウザ
菊野玲子

紹介データベース
HUGE（Human Unidentified Gene-Encoded Large Proteins）

5 The Gene Index Projec（t TGI） ESTデータベース
野見山尚之・棚瀬純男

紹介データベース
サイトカインファミリーcDNAデータベース（dbCFC）

6 Protein Data Bank（PDB）立体構造データベース
金城玲・西川建

紹介データベース
GTOP（Genome TO Protein structures and functions）

7 GeMDBJ Proteomics 二次元電気泳動法による癌プロテオームデータベース
近藤格

8 GENSAT，Allen Brain Atlas，Human Protein Atlas
古閑比佐志・池田俊

紹介データベース
ATUM（Antibody-Transcription Utilize Menu）

9 BRENDA 酵素反応データベース
五斗進

紹介データベース
KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）

10 The Mouse Genome Informatics（MGI） MGIの便利な使い方
濱田理人・高橋智

11 IGTC ノックアウトマウスを作製する前にチェックすべき変異ESデータベース
荒木正健・荒木喜美

紹介データベース
可変型遺伝子トラップクローンデータベース（EGTC）

12 IMSR 世界のマウスデータベース
加藤秀樹

紹介データベース
CARD R-BASE 中潟直己

13 Rat Genome Database（RGD）ラットゲノムの包括的データベース
庫本高志・岡島涼子

14 FlyBase ショウジョウバエゲノムデータベース
山本雅敏

紹介データベース
DGRC（Drosophila Genetic Resource Center）
JDD（Japan Drosophila Database）

15 WormBase 線虫のゲノム統合データベース
三谷昌平

16 ZFIN ゼブラフィッシュの統合データベース
大畑慎也・蘇峰・古谷-清木誠

17 TAIR シロイヌナズナの総合的な研究情報サイト
中村保一

紹介データベース
CyanoBase / RhizoBase / KazusaAnnotation
Lotus japonicus genome sequencing project

18 SoyBase ダイズ遺伝育種研究のためのデータベース
阿部純・山田哲也

19 dictyBase 社会性アメーバ「細胞性粘菌」の総合データベース
漆原秀子

20 GeneDB，SGD 究極のモデル真核生物酵母の研究を支えるデータベース
中村太郎

■　第2部バイオリソース

1 マウス(1) 世界最高水準のマウスリソースの整備
吉木淳・小幡裕一

2 マウス(2) マウス亜種間コンソミック系統の開発とその利用
城石俊彦

3 マウス(3) 大規模ノックアウトマウスプロジェクトとその実例
山村研一

4 ラット多様なニーズに応える実験動物
真下知士・芹川忠夫

5 ショウジョウバエ基礎遺伝学から疾病遺伝学のモデル生物
山本雅敏

6 線虫機能ゲノミクスのためのモデル生物
三谷昌平

7 両生類実験動物 Xenopus tropicalisを中心として
矢尾板芳郎・伊藤弓弦・浅島誠

8 カイコアジア発のカイコリソースの魅力
伴野豊

9 メダカ生命科学研究の統合的生物遺伝資源を目指して
成瀬清・笹土隆雄・田中実・酒泉満・佐藤忠

10 ゼブラフィッシュ発生研究から行動解析までできる遺伝学的モデル脊椎動物
岡本仁

11 ニホンザル日本の脳科学を支える日本固有の動物種
山根到・稲垣晴久・伊佐正

12 大型類人猿モノと情報のネットワーク
吉川泰弘・倉島治・長谷川寿一・平井百樹・石田貴文・松沢哲郎・早坂郁夫・落合-大平知美

13 カタユウレイボヤ・ニッポンウミシダ海産無脊椎動物を代表する研究材料
笹倉靖徳・稲葉一男・赤坂甲治・佐藤矩行

14 ヒドラ共通祖先の体制を垣間みることができる「生きた化石」
清水裕

15 ニワトリ・ニホンウズラ鳥類の代表的なモデル生物
吉村崇・森誠

16 シロイヌナズナ植物研究のグローバルスタンダード
小林正智

17 イネ遺伝子資源・ゲノムリソースの現状と展望
倉田のり・野々村賢一

18 コムギ倍数体のモデル植物
遠藤隆・河原太八・那須田周平・辻本壽・笹沼恒男・荻原保成

19 オオムギその多様性とゲノムリソース
佐藤和広

20 藻類多様性からモデル生物まで
笠井文絵・平林周一

21 広義キク属東アジアで同質倍数性ゲノム進化を遂げた植物群
草場信・谷口研至・増田優

22 アサガオ日本生まれのモデル植物
仁田坂英二

23 ミヤコグサ・ダイズモデル植物から作物への展開
橋口正嗣・権藤崇裕・明石良

24 トマト次世代モデル植物のバイオリソース
江面浩・浅水恵理香

25 細胞性粘菌多面的有用性を秘めたモデル真核微生物
漆原秀子

26 病原微生物リサーチツールとしての利用
三上襄

27 微生物健康と環境の研究に資するリソースの確保
辨野義己

28 大腸菌･枯草菌モデル原核生物の遺伝資源
仁木宏典

29 酵母究極のモデル真核生物
下田親

30 きのこ類多様な潜在的機能を持つ遺伝資源の収集保存
前川二太郎・須原弘登

31 遺伝子材料みんなで使おうDNAリソース
横山和尚・村田武英・潘建治

32 ヒトES細胞多能性幹細胞のゴールドスタンダード
末盛博文・中辻憲夫

33 細胞一般細胞株・幹細胞・遺伝子解析用細胞
中村幸夫

34 地球規模生物多様性情報機構標本と観測の世界を創る
菅原秀明

35 バイオリソース（生物遺伝資源）情報センター
バイオリソースの新たな価値創出型情報拠点を目指して
山崎由紀子

36 JCRB細胞バンク創薬・医学研究を支える高品質ヒト由来培養細胞の供給
小原有弘・水澤博

37 JCRB遺伝子バンク疾患研究と創薬にむけた遺伝子バンク
長田直樹・亀岡洋祐・高橋一朗

38 NBRC 微生物の産業利用のための生物遺伝資源センター
鈴木健一朗・藤田克利・市原正巳

39 イネゲノムリソースセンターイネゲノム研究から生まれたゲノムリソースと情報リソース
Baltazar A. Antonio・宮尾安藝雄・長村吉晃

40 LMO（Living Modified Organism）のABC 遺伝子組換え生物等規制法の再確認
荒木正健

41 マテリアル・トランスファー・アグリーメント（MTA）
鈴木睦昭

42 品質管理培養細胞に潜む誤謬と汚染の排除
水澤博・楠田-古江美保・増井徹・小原有弘

■　索引